Associatie tussen uremische toxines en het intestinale microbioom

Chronische nierziekte (CNZ), een aandoening die vaker voorkomt bij vrouwen, is een complexe multifactoriële aandoening. Daarenboven is CNZ geassocieerd met een verhoogd risico op cardiovasculaire aandoeningen. Ongeveer 50% van alle CKD-patiënten sterven aan de gevolgen van deze cardiovasculaire aandoeningen. In dit project zal de darm-nieras en de bijdrage van het intestinale microbioom als belangrijke factor in het ontstaan en de evolutie van zowel CNZ als cardiovasculaire aandoeningen onderzocht worden. Hierbij zal nagegaan worden of het intestinale microbioom kan dienen als therapeutisch doel om de uitkomst van CNZ-patiënten te verbeteren. Om de rol van specifieke intestinale bacteriële species in de ontwikkeling van CNZ te bestuderen, zullen bio-informatische analyses gecombineerd worden met microbiële cultiverings- en fermentatietechnieken. Meer specifiek zal de associatie tussen deze microbiële species en de productie van (uremische) metabolieten onderzocht worden. Deze metabolieten zijn gekend om hun toxische effecten. In het bio-informatische luik zal de impact van de samenstelling van lichaamsvloeistoffen op de intestinale microbiota bestudeerd worden door gebruik te maken van data- en hypothesegedreven methodes. De resulterende bio-informatische observaties worden daarna gevalideerd via in vitro-experimenten. Hiervoor worden specifieke toxineproducerende bacteriële species geïsoleerd uit fecale stalen van CNZ-patiënten en anaërobische gecultiveerd. Een state-of-the-art parallel microfermentatiesysteem laat toe om via cocultivatie van deze toxineproducerende species met bio-informatisch voorspelde microbiële interactiepartners zowel positieve als negatieve interacties nauwkeurig in kaart te brengen. Dankzij de combinatie van bio-informatische analyses met in vitro cocultivatie-experimenten kan de rol van de intestinale microbiota op de darm-nieras nauwkeurig onderzocht worden. Hierdoor kunnen nieuwe therapeutische doelen geïdentificeerd worden voor de ontwikkeling van microbioomgebaseerde therapieën.