< Terug naar vorige pagina

Project

Sabbatperiode: Dirk Springael: Meta-proteomics as a tool to assess community-wide activity of the mobile genetic element - insertion element IS1071

Horizontale genoverdracht (HGT) speelt een belangrijke rol bij microbiële aanpassing. HGT wordt beheerst door de "Mobilome", d.w.z. de pool van mobiele genetische elementen (MGE's) inclusief plasmiden, transposons, insertie sequenties, integronen enz. Hun aanwezigheid en overvloed in microbiële gemeenschappen kan worden aangetoond door technieken als kwantitatieve PCR en meta-genomics, maar dat betekent niet noodzakelijk dat hun activiteit afhankelijk is van beide transcriptionele en (post) translationele regulering. Dit project beoogt inzicht te verwerven in het potentieel van metaproteomica om direct inzicht te krijgen in functioneel actieve MGE's in complexe gemeenschappen gericht op insertie sequentie IS1071 (bij UMons). Daarnaast zal er tijd worden besteed aan UCL om in het genomische landschap van IS1071 te duiken

Datum:7 feb 2021 →  31 jul 2021
Trefwoorden:meta-proteomics, insertion element IS1071, horizontal gene transfer, microbial adaption, mobile genetic elements
Disciplines:Proteomics, Genomics, Genoomstructuur en -regulatie, Milieu ingenieurswetenschappen en -biotechnologie niet elders geclassificeerd