IDENTIFICATIE, MOLECULAIRE CHARACTERISATIE EN KWANTIFICATIE VAN AEDES MOSQUITO-BORNE VIROME IN KAMEROEN

De wereldwijde volksgezondheid wordt in toenemende mate bedreigd door nieuwe pathogenen die in de meeste gevallen afkomstig zijn van wilde dieren, en die enorme gevolgen kunnen hebben voor de menselijke gezondheid. De meeste van deze pathogenen worden overgedragen door verschillende geleedpotigen die zich voeden met bloed, in het bijzonder muggen. Muggen zijn efficiënte vectoren voor verschillende pathogenen zoals Plasmodium spp., filariale nematoden, Zika virus, Dengue virus, Rift Valley fever virus en gele koorts virus. Dergelijk arthropod-borne viruses (of arbovirusen) zijn verantwoordelijk voor minstens 35 infecties van de mens die overgedragen worden door muggen in Afrika, inclusief Kameroen. Daarom bestaat er een toenemende interesse in het beter kennen en verstaan van het muggenviroom, en meer specifiek hun diversiteit en compositie. De meerderheid van de muggenvirussen zijn zeer divergent (<70% aminozuur identiteit) en hun pathogeniciteit voor mensen in onbekend. Surveillance van arbovirussen die circuleren in specifieke muggen species in verschillende regio's is noodzakelijk aangezien de bevindingen fundamenteel belangrijk kunnen zijn om strategieën te ontwikkelen voor voorspellingen, preventive en controle van virale ziekten. Daarom zijn muggenviroomstudies en veelbelovende tool voor dergelijke surveillance. Bovenop arbovirussen die kunnen repliceren in vertebraatcellen, bevat het muggenviroom een groot aantal mug specifieke virussen die enkel muggen en muggencellijnen kunnen infecteren in vitro. Hoewel insect-specifieke virussen niet repliceren in vertebraten, zijn sommige van hen fylogentisch verwant met pathogene arbovirussen, en vermoedt men dat ze potentieel kunnen evolueren tot virussen die pathogeen zijn voor vertebraten. Factoren zoals klimaat, begroeiing en urbanisatie beïnvloeden de verspreiding van Aedes muggen in Kameroen, met Aedes aegypti aanwezig over het hele land, en Aedes albopictus beperkt tot het Zuidelijke deel van het land. Deze verschillen in de verspreiding van muggensoorten wordt gereflecteerd in the circulate van hun respectievelijke arbovirussen. Bovendien is de respons tegen opkomende arbovirussen onvoldoende in dergelijke settings. Een snelle en accurate identificatie van deze arbovirussen is essentieel voor de diagnose en reactie op opkomende virale ziektes. De opmars van next-generation sequencing technologieën zorgt voor een revolutionair platform voor een snelle sequentie-gebaseerde identificatie van nieuwe virussen. In deze studie zal een metagenoom aanpak gebruikt worden voor de identificatie en karakterisatie van het viroom, en de bepaling van zijn virusdiversiteit in Ae aegypti en Ae albopictus muggen in verschillende klimaatzones van Kameroen. Deze resultaten zullen niet enkel een goed beeld geven over welke virussen (identiteit, diversiteit en abundantie) aanwezig zijn in Aedes spp. in Kameroen, maar zullen ook bijdragen aan de groeiende en belangrijke kennis hierover, aangezien het viroom van muggen gemanipuleerd kan worden om de verspreiding van pathogenen arbovirussen te voorkomen of te controleren of in geval van eventuele uitbraken te bestrijden.