< Terug naar vorige pagina

Project

Datagestuurde modellering van celvormen en bewegingen in meercellige systemen.

Doorgronden hoe cellen bewegen en zichzelf positioneren in een

meercellige setting is cruciaal voor het begrijpen van een

verscheidenheid aan biologische processen zoals embryogenese,

weefselvorming en vele ziekten. Dit is een zeer dynamisch proces,

waarbij cellen bewegen en van vorm veranderen, geleid door zowel

biochemische als fysieke signalen. Een nauwkeurige reconstructie

van de celvorm doorheen de tijd biedt gedetailleerde informatie over

krachtgeneratie in een cel en krachtoverdracht tussen naburige

cellen. Het uitlezen van 3D-celvormen uit microscopie blijft echter

een uitdaging, vooral wanneer cellen een onregelmatige vorm

hebben. In dit project wordt een nieuwe benadering voorgesteld die

een biofysisch celmodel gebruikt om celvormen automatisch te

reconstrueren uit microscopische beelden met gelabelde

celmembranen. Een ontwikkelend C. elegans embryo zal als model

worden gebruikt. De gereconstrueerde celvormen worden vervolgens

gebruikt om het effect van een genetische perturbatie op de

celgeometrie kwantitatief te beoordelen. Vervolgens zullen celvormen

worden geanalyseerd om bio-mechanische parameters zoals

corticale spanning en cel-celadhesie af te leiden, tesamen met de

actieve krachten die vormverandering en celbeweging aandrijven.

Ten slotte zal de aanpak worden uitgebreid tot een platform voor

datagestuurde mechanische modellering van meercellige

bewegingen. Om dit kracht bij te zetten zal een verklarend model

worden gemaakt van vroege C. elegans gastrulatie.

Datum:1 okt 2019 →  Heden
Trefwoorden:cell shape reconstruction, biomechanical modeling, microscopy analysis
Disciplines:Datavisualisatie en high-throughput beeldanalyse, Moleculaire en cellulaire biomechanica
Project type:PhD project