< Terug naar vorige pagina
Project
De rol van ubiquitinering in faseovergangen bij Amyotrofische Laterale Sclerose (ALS) (FWOTM959)
ALS is een neurodegeneratieve aandoening, gekenmerkt door het verschijnen van ge-ubiquitineerde eiwitinsluitsels in motorneuronen. De belangrijkste eiwitcomponent van deze insluitsels is een RNA- bindend eiwit genoemd TDP-43. De consensus is dateiwit- ubiquitinering bij ALS-insluitsels een teken is van een mislukte poging van de cel om misgevouwen/geaggregeerde eiwitten te degraderen via het ubiquitine-proteasoomsysteem of autofagie
pathway. We veronderstellen echter dat eiwit componenten van ALS- geassocieerde insluitsels ubiquitine-bindende motieven/domeinen kunnen bevatten die een promiscue interactie kunnen vertonen met ubiquitine-ketens die op inclusielichaameiwitten worden geplaatst om de balans naar proteïneaggregatie te kantelen. Om deze hypothese te testen, hebben we gegevens verzameld over alle bekende ALS- inclusie-eiwitten en gescreend op eerder gerapporteerde ubiquitine- bindende eiwitten of eiwitten die ubiquitine-bindende domeinen herbergen. Van deze analysewerden hebben we enkele ubiquitine- bindende eiwitten en eiwitten met bekende ubiquitine-bindende motieven geïdentificeerd. De volgende stappen omvatten screening van de sterkste ubiquitine-bindende eiwitten waarvan de interactie met TDP-43 later zal worden beoordeeld in aan- en afwezigheid van ubiquitinering. Ten slotte willen we begrijpen hoe ubiquitinering de vorming van actieve biomoleculaire condensaten beïnvloedt onder fysiologische omstandigheden die later eiwitaggregatie tijdens ziekteprogressie mediëren.
pathway. We veronderstellen echter dat eiwit componenten van ALS- geassocieerde insluitsels ubiquitine-bindende motieven/domeinen kunnen bevatten die een promiscue interactie kunnen vertonen met ubiquitine-ketens die op inclusielichaameiwitten worden geplaatst om de balans naar proteïneaggregatie te kantelen. Om deze hypothese te testen, hebben we gegevens verzameld over alle bekende ALS- inclusie-eiwitten en gescreend op eerder gerapporteerde ubiquitine- bindende eiwitten of eiwitten die ubiquitine-bindende domeinen herbergen. Van deze analysewerden hebben we enkele ubiquitine- bindende eiwitten en eiwitten met bekende ubiquitine-bindende motieven geïdentificeerd. De volgende stappen omvatten screening van de sterkste ubiquitine-bindende eiwitten waarvan de interactie met TDP-43 later zal worden beoordeeld in aan- en afwezigheid van ubiquitinering. Ten slotte willen we begrijpen hoe ubiquitinering de vorming van actieve biomoleculaire condensaten beïnvloedt onder fysiologische omstandigheden die later eiwitaggregatie tijdens ziekteprogressie mediëren.
Datum:1 nov 2019 → 31 jan 2024
Trefwoorden:Amyotrophic lateral sclerosis, ALS
Disciplines:Moleculaire en celbiologie niet elders geclassificeerd, Posttranslationele modificaties, Andere biotechnologie, bio-en biosysteem ingenieurswetenschappen niet elders geclassificeerd