Het effect van industrialisatie op de multi-domein darmflora in functie van tijd en geografie

De menselijke microbiota is een rijk ecosysteem bestaande uit diverse bacteriën, archaea, eukaryoten en virussen die specifieke niches van het menselijk lichaam innemen. Het meest diverse en dichtst bevolkte microbieel ecosysteem van het menselijk lichaam bevindt zich in het darmstelsel. Dit project dient als beginpunt voor een grotere, langdurige studie: The Microbiome Observatory of Industrialization met als doel de dynamiek en adaptatie van de menselijke darmmicrobiota in kaart te brengen in bevolkingsgroepen die snel evolueren naar een geïndustrialiseerde levenswijze. Opeenvolgende veranderingen in de microbiota, waaronder het verdwijnen van soorten, toenemen van zeldzame soorten en verwerven van nieuwe soorten, zullen worden geanaliseerd. Deze observaties zullen gelinkt worden aan objectieve indicatoren van de overgang naar industrialisatie, waaronder gezondheid en levensstijl op niveau van het individu en de gemeenschap. Het project richt zich op een bevolkingsgroep die momenteel een snelle overgang naar industrialisatie doormaakt, de Matsés uit het hart van de Amazonewoud. We zullen een bestaande werkwijze gebruiken (MRDP: Microbiota Research and Discovery Pipeline) om de taxonomie en functie van de darmmicrobiota in detail te bestuderen. MRDP integreert verschillende -omics data met in vitro en in vivo modellen en laat toe de darmmicrobiota te bestuderen op zowel taxon niveau als op het niveau van het volledige microbieel ecosysteem.