< Terug naar vorige pagina

Project

CRISPRi screening voor de studie van genetische mechanismen verantwoordelijk voor persistentie in Escherichia coli

Urineweginfecties (UTI's) zijn een wereldwijd gezondheidsprobleem en worden voornamelijk veroorzaakt door uropathogene Escherichia coli (UPEC). Het falen van een antibioticumbehandeling en de vaak chronische aard van UTI’s worden toegeschreven aan een kleine fractie van tijdelijk niet-groeiende, antibioticum-tolerante cellen genaamd persistors. Een innovatieve manier om chronische UTI’s te genezen zou eruit bestaan om groeiherstel in persistors te induceren, waardoor ze opnieuw gevoelig worden voor conventionele antibiotica. Helaas is de huidige kennis omtrent persistor-ontwaken eerder beperkt, wat de ontwikkeling van antipersistormedicijnen bemoeilijkt. Het doel van dit project is om inzicht te krijgen in het ontwaken van UPEC persistors met behulp van op proteomicagebaseerde benaderingen. In een eerste stap zullen we het werkingsmechanisme ontrafelen van een persistentieregulator die recent in onze groep werd ontdekt. Daarnaast zullen we proteoomanalyses uitvoeren op ontwakende persistorcellen om determinanten te vinden die aan de basis liggen van het ontwaken. Deze eiwitten zullen worden onderworpen aan functioneel en biochemisch onderzoek. Ten slotte zullen we een muismodel voor persistentie ontwikkelen en implementeren om onze bevindingen in vivo te valideren. Dit project zal leiden tot nieuwe inzichten in persistor-ontwaken en bijdragen tot de ontwikkeling van diagnostische tests voor persistentie en antipersistermedicijnen om UTI’s te bestrijden.

Datum:15 sep 2020 →  Heden
Trefwoorden:Persister awakening, Proteomics, UPEC
Disciplines:Biochemie en metabolisme niet elders geclassificeerd, Moleculaire en celbiologie niet elders geclassificeerd, Proteomics, Microbiële diagnostiek, Klinische microbiologie
Project type:PhD project