< Terug naar vorige pagina

Project

Computationele methodes om cellulaire heterogeniteit to ontrafelen

Cellulaire identiteit en heterogeniteit liggen aan de basis van verschillende aspecten van normale ontwikkeling en fysiologie, maar worden verstoord door ziekten zoals kanker. Cellulaire identiteit wordt deels gecodeerd in het epigenoom, dat de stabiliteit van genexpressieprogramma's regelt. Hoe epigenetische processen cellulaire heterogeniteit regelen is echter onbekend, gedeeltelijk omwille van een historisch gebrek aan methoden om cellulaire heterogeniteit in zijn fundamentele eenheid, de cel, te bestuderen. Dankzij de recente ontwikkeling van single cell omics-technologieën kunnen we nu heterogeniteit op cellulair niveau bestuderen. In dit proefschrift zullen meerdere omics-technologieën, waaronder single-cell sequencing, worden toegepast om de rol van epigenoom in de controle van heterogeniteit te begrijpen, vooral bij kankerpatiënten. Het werk in dit proefschrift omvat de analyse van deze omics-gegevens en de ontwikkeling van nieuwe computationele methoden om de heterogeniteit in single-cell omics-datasets te kwantificeren en te begrijpen.

Datum:5 feb 2020 →  5 feb 2024
Trefwoorden:epigenetics, bio-informatics, cellular heterogeneity, transcription, cancer
Disciplines:Computationele transcriptomics en epigenomics, Kankerbiologie, Epigenetica, Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie
Project type:PhD project