Identificatie van RNA biomerkers van ultrasnelle gevoeligheidsbepaling en het testen van optimale drugcombinaties voor het mycobacterium avium complex.

Progressief pulmonaire infecties door species van het Mycobacterium avium–intracellulare complex (MAC) zijn meer en meer prevalent in geïndustrialiseerde landen. Ze zijn behandelbaar, maar een doorsnee regime duurt 12 maanden en omvat combinaties van meerdere antibiotica. Een kernprobleem dat de ontwikkeling van nieuwe of meer efficiënte behandelingen in de weg staat, is het ontbreken van een snelle diagnostische test voor druggevoeligheid in MAC. De huidige methoden zijn extreem traag (3-5 weken), slecht reproduceerbaar en moeilijk te interpreteren. In dit project ontwikkelen we een nieuwe gevoeligsheidstest voor MAC. Ons kernidee is dat een gevoelige bacterie stress voelt in aanwezigheid van een antibioticum, en een resistente niet. De test is dan ook gebaseerd op multiplex metingen van relatieve hoeveelheden van drug-specifieke mRNA merkers na contact met een antibioticum. Dit concept is totaal vernieuwend. Het onderzoek start met transcriptie analysen van MAC onder druk van antibiotica. We zullen probes ontwikkelen om meest uitgesproken stressgenen in multiplex te kwantificeren via Luminex. De parameters van de RNA-gebaseerde drugtest worden geoptimaliseerd met een klinisch relevante set van MAC isolaten. Tenslotte zullen we dit platform gebruiken om synergetische interacties op te sporen tussen oude en nieuwe anti-MAC antibiotica. Het einddoel is een optimale combinatie van antibiotica te identificeren, met de grootst mogelijke impact op klinische MAC isolaten.

Trefwoorden:TRANSCRIPTOMICS, PULMONOLOGIE

Disciplines:Infectieziekten, Microbiële diagnostiek

Project type:Samenwerkingsproject