De analyse van RNA-Seq gegevens door veralgemeende lineaire modellen met normale en verwante willekeurige effecten (R-6244)

Het doel van dit project is het aanpassen en toepassen van veralgemeende lineaire modellen met normale en verwante willekeurige effecten voor de analyse van RNA-Seq gegevens. Deze modellen corrigeren, in het bijzonder, voor overdispersie, wat één van de belangrijkste kenmerken van de RNA-Seq aantallen-verdeling is. Hiernaast laten deze modellen de introductie van willekeurige effecten op verschillende niveaus toe. Hierdoor kan er rekening gehouden worden met de onderliggende, hiërarchisch georganiseerde structuur van de RNA-Seq gegevens. Dankzij deze modellen kunnen de gegevens van complexe RNA-Seq experimenten, zoals experimenten met gekoppelde observaties, geanalyseerd worden. De deugdelijkheid van de resultaten van deze veralgemeende lineaire modellen zal onderzocht worden met gesimuleerde en reële gegevens.

Trefwoorden:RNA-Seq gegevens

Disciplines:Toegepaste wiskunde, Statistische en numerieke methoden