< Terug naar vorige pagina

Project

Biogeografische analyse van het darmmicrobioom

Om de verschillende rollen van de menselijke darmmicrobiota en zijn relatie met de fysiologie van de gastheer beter te begrijpen, is het noodzakelijk om de menselijke darmmicrobiota in verschillende niches langs het maagdarmkanaal te karakteriseren en de overgangen in gemeenschapssamenstelling langs zijn verschillende te verkennen compartimenten. De variabiliteit in het microbioom langs het maagdarmkanaal kan te wijten zijn aan verschillende factoren, waaronder de fysiologische verschillen tussen compartimenten. Tot op heden hebben de meeste onderzoeken naar darmmicrobiomen zich gericht op fecale monsters als proxy's van colonmicrobiota, of in mindere mate, colonbiopten. Er zijn slechts enkele onderzoeken die hebben overwogen om ook het bovenste GI-microbioom te analyseren. Zoals geconcludeerd uit deze studies, varieert de microbioombelasting in het GI-kanaal op de manier dat verschillende taxa aanzienlijk over- of ondervertegenwoordigd zijn in het GI-kanaal, en in totaal is de lagere GI rijker met betrekking tot het aantal soorten en het totaal bacteriële belasting vergeleken met de bovenste GI. In dit project zullen we het hele maagdarmkanaal analyseren om te onderzoeken hoe de darmflora varieert over de lengte en diepte van het kanaal met betrekking tot de algehele diversiteit en prevalentie van verschillende taxa, en hoe deze veranderingen samenhangen met de verschillen in de fysiologie en kenmerken van de gastheer langs het maag-darmkanaal. Bovendien zullen we met dit werk nieuwe bacteriële stammen van potentieel belang voor biomedische toepassingen kunnen identificeren en isoleren.

Datum:15 apr 2019 →  21 nov 2021
Trefwoorden:gut microbiome, biogeography, gut biogeography, microbiome mapping
Disciplines:Microbioom
Project type:PhD project