< Terug naar vorige pagina

Project

Detectie van alternatieve splicing in de eerste fasen bij ontwikkeling van medicatie. (R-5464)

Duizenden genen bevatten duizenden exons die honderdduizend verschillende transcript isovormen produceren. De recente ontwikkelingen in genomica bieden enorme mogelijkheden voor het onderzoek naar detectie van alternatieve splicing van DNA. Zo'n potentieel is echter beperkt door het gelimiteerde vooruitgang in statistische methodologie. Dit voorgestelde doctoraat focust op zowel de evolutie in de ontwikkeling van de methodologie voor de detectie van alternatieve splicing en de toepassing van deze in de vroege fasen van ontwikkeling van medicatie. Het voorgestelde werkplan is gebaseerd op een mixel model framework. Deze voorziet in een intuïtieve benadering van alternatieve splicing detectie. Het vaste effect van een mixed model representeert het geneffect terwijl de random componenten wijzen op de individuele afwijking van de exons van het geassocieerde genprofiel. De grootte van de afwijkingen is een goede indicatie of het gen daadwerkelijk alternatief uitgedrukte exons bevat. Dit doctoraat bestudeerd ook de uitgebreide analyse van intern en publiek beschikbare experimenten over gesplicede varianten en de groepering van gedecteerde alternatieve splicing volgens de meest waarschijnlijke splicing mechanismen. Dit project onthult de wetenschap achter alternatief uitgedrukt varianten en hun potentieel as therapeutische targets en biomarkers.
Datum:1 okt 2014 →  30 sep 2018
Trefwoorden:EPIDEMIOLOGIE EN VOLKSGEZONDHEID
Disciplines:Toegepaste wiskunde, Statistische en numerieke methoden