Fylogenomische basis voor fenotypische diversiteit in zoetwater bacteriële gemeenschappen

Zoetwater ecosystemen zijn actieve hotspots van microbiële biogeochemische processen, en zowel de biodiversiteit als de functies van deze ecosystemen worden momenteel bedreigd door global change. Gezien de samenstelling van microbiële gemeenschappen bepaald wordt door omgevingsfactoren, moeten we verstaan hoe structurele veranderingen aanleiding geven tot functionele veranderingen. Om dit probleem te ontrafelen, gaat dit onderzoeksproject observeerbare (fenotypische) en genomische (genotypische) eigenschappen van individuele bacteriële cellen bestuderen, en deze associëren met de functies en genomische adaptaties van bacteriële populaties in het ecosysteem. We focussen op het grootste zoetwater ecosysteem, de Grote Meren, hetgeen drastisch is gewijzigd door global change, met ongekende gevolgen voor de bacteriële gemeenschap. Onze aanpak bestaat uit het integreren van fenotypische informatie verkregen d.m.v. flowcytometrie, met genotypische informatie verkregen d.m.v. single-cell sequenering. Deze data-integratie zal leiden tot een gedetailleerd inzicht in de associatie tussen fenotypische en genotypische eigenschappen van bacteriële populaties in het milieu, hoe bacteriële populaties hun fenotypische eigenschappen wijzigen in het milieu, en hoe deze bijdragen tot ecosysteemfuncties. Deze kennis zal ons toelaten om flowcytometrie-gebaseerde modellen in te zetten als toolbox om zoetwater ecosystemen te managen door ze te sturen naar deze met gewenste functionele kenmerken.