Eiwit communicatie tijdens de ontwikkeling van arbusculaire mycorrhiza: het ontrafelen van de functie van tomatenworteleiwitten die interageren met schimmel effectoren

Arbusculaire mycorrhiza (AM) schimmels vormen een mutualistische associatie met meer dan 80% van alle landplanten. Deze symbiotische interactie wordt tot stand gebracht door een strikt gecontroleerde signaaluitwisseling waarbij de schimmel ook de verdediging van de plant onderdrukt. Uit het veld van de fytopathologie weten we dat dit wordt gedaan door de secretie van effectoreiwitten en ook AM-schimmels secreteren effectoren maar er is weinig bekend over hun rol in de plant. In ons project zullen we de state-of-the-art over deze AM-effectoren uitbreiden door te onderzoeken met welke planteiwitten ze interageren en hoe dit de ontwikkeling van de mutualistische interactie beïnvloedt. Hiervoor concentreren we op de associatie van Rhizophagus irregularis met zijn gastplant tomaat. Eerst zullen we een netwerk van tomatenworteleiwitten identificeren die interageren met schimmel effectoren via high-throughput analyse d.m.v. Y2H-Seq. Na verificatie, zullen we de innovatieve proteomics-techniek BioID gebruiken om het verkregen netwerk te verifiëren en aan te passen. Ten slotte zullen we de rol van drie centrale eiwitten in plantengroei verder bestuderen met een multidisciplinaire aanpak waarbij fenotypering wordt gecombineerd met moleculaire, fysiologische en biochemische methoden. Onze bevindingen zullen de huidige internationale belangstelling voor AM-effectorbiologie en de tomaat onderzoeksgemeenschap ten goede komen door nieuwe inzichten te leveren in het veld van de interactomics