Gekke wortelziekte: bepalen van de moleculaire processen die aan de basis liggen van de vorming van gekke wortels in tomaat na infectie met rhizogene agrobacteria

Bij tomatenplanten leidt de gekke wortelziekte, veroorzaakt door rhizogene agrobacteria, tot overmatigewortelgroei en geassocieerde opbrengstverliezen. Wereldwijd breidt deze ziekte zich zeer snel uit bij vruchtgroenten onder glas. Rhizogene agrobacteria bevatten een wortel-inducerend plasmide waarvan een deel (T-DNA) wordt getransfereerd naar de plant. Tot hiertoe werden moleculaire mechanismen die cruciaal zijn tijdens de interactie tussen tomatenwortels en Agrobacterium nog niet in detail bestudeerd. Dit project heeft daarom als doel een beter omvattend moleculair en fenotypisch beeld te brengen van de verschillende stappen tijdens de ontwikkeling van gekke wortelziekte waarbij we zowel focussen op de bacteriële karakteristieken als op de respons in tomatenwortels. In eerste instantie zal er een vergelijkende genoomstudie worden uitgevoerd van verschillende Agrobacterium isolaten waarbij we genetische kenmerken willen identificeren die resulteren in een verschil in virulentie, ontwikkeling van gekke wortels of biofilm-vormende capaciteit. Tenslotte zullen we d.m.v. een cel-specifieke vergelijkende transcriptoomstudie van tomatenwortels geïnfecteerd met Agrobacterium muntanten nagaan via welke moleculaire processen T-DNA gecodeerde proteïnes de vorming van deze gekke wortels beïnvloeden. Samengevat stellen we een geïntegreerde benadering voor waarbij verschillende technologieën zullen gebruikt worden om een beter beeld te krijgen van de sleutelprocessen tijdens de ontwikkeling van gekke wortels.

Trefwoorden:Rhizogenic Agrobacterium, Tomato, Hairy roots, Rol genes, Comparative genomics, Ri plasmid

Disciplines:Plantenecologie