Het onderzoeken van de opeenvolging en functionele landschappen van natuurlijke en gemanipuleerde polymerasen

Xenobiotische nucleïnezuren (XNAs), chemische analogen van de enige genetische polymeren van de natuur (DNA en RNA), kunnen niet alleen genetische informatie opslaan en verspreiden, maar ook de chemische diversiteit van genetische polymeren en hun biotechnologische en farmaceutische toepassingen verbreden. De synthese van XNA wordt echter beperkt door de lage efficiëntie en het gebrek aan selectiviteit van de huidige generatie van gemanipuleerde XNA-polymerasen. Dit project beoogt een beter begrip te krijgen van de functionele ruimte van DNA / RNA-polymerasen om efficiëntere XNA-polymerasen te genereren. Door middel van diepgaand mutationeel scannen en landschapskartering van complexe mutagenesebibliotheken (pre- en post-selectie voor DNA of XNA-synthese / replicatie) zal de functionele ruimte van polymerasen worden onderzocht en zullen tekenen van interacties, synergismen en co-variatie tussen residuen worden geïdentificeerd. Dit project zal het mogelijk maken functionele interactienetwerken te reconstrueren om de eiwittechnologie te verbeteren en tegelijkertijd efficiëntere XNA-polymerasen te identificeren.