< Terug naar vorige pagina

Project

Transcriptionele netwerk van patroonvorming van neurale buis organoïden en in vivo ruggenmerg

Neurale buisdefecten (NTD) zijn afwijkingen van de ontwikkeling van het centrale zenuwstelsel die worden gekoppeld aan fysieke problemen en/of intellectuele handicaps. Met diermodellen zijn meer dan 200 genen geïdentificeerd die betrokken zijn bij NTD. Omgevingsfactoren spelen ook een belangrijke rol, zoals blijkt uit de impact van foliumzuur op de NTD-prevalentie. Helaas beschrijven diermodellen het menselijke NTD-fenotype niet volledig en ontbreekt een menselijk neuraal buismodel. Onlangs is een spina bifida aperta (SBA) celmodel ontwikkeld, SBA is een ernstige type NTD. Hoewel cel modellen nuttig zijn, waarborgen ze niet de complexiteit en patroonvorming van het ruggenmerg. Met behulp van organoïden, 3D-zelforganiserende structuren, is het mogelijk om meer complex weefsel na te bootsen dat NTD met meer nauwkeurigheid kan modelleren. In dit project stellen we voor om een model te maken met behulp van hPSC's die de patroonvorming van het zich ontwikkelende ruggenmerg kan na bootsen. Met behulp van een biomimetische extracellulaire matrix kunnen wij optimaal patroon en groeiomstandigheden verfijnen. Vervolgens zullen we de menselijke neurale buisachtige organoïde (hNTO) verder karakteriseren met behulp van scRNA-sequencing (scRNA-seq), waarmee we de cellulaire samenstelling en onderliggende genetische mechanismen van de NTO's kunnen onderzoeken. Dit zal gunstig zijn om het hNTO en SBA-model te valideren en de onderliggende mechanismen van NTD's verder te onderzoeken. In conclusie zal dit project een robuust neurale buis model teweegbrengen die mogelijkheid biedt om de mechanisme van NTD en ontwikkeling in mensen in hoge resolutiete onderzoeken.

Datum:1 feb 2019 →  30 jun 2023
Trefwoorden:Neural Tube Defects, Organoids, Spina Bifida Aperta, Single Cell RNA sequencing, Biomimetic matrices
Disciplines:Bio-informatica data-integratie en netwerkbiologie, Weefselengineering
Project type:PhD project