Genomic Driven Approach voor het identificeren van moleculaire biomerkers en therapeutische doelen voor GlioblastomaGenomic Driven Approach voor het identificeren van moleculaire biomerkers en therapeutische doelen voor Glioblastoma

GBM is de prototypische ziekte waarbij toekomstige therapieën waarschijnlijk afhankelijk zijn van het vaststellen van het genotype en het proteomische profiel van een mannelijke of vrouwelijke patiënt met behulp van robuuste biomarkers. Er wordt dus verwacht dat een of meerdere pathognomonische biomarkers informatie zullen verschaffen die clinici zullen helpen bij het diagnosticeren en behandelen van patiënten. Dit project is gericht op het ontwerpen van een NGS-gebaseerde bioinformatica-pijplijntest voor gecombineerde mutatie en somatische kopie-aantalveranderingen (SCNA's) analyse van GBM's en zal genomische biomarkers verbinden met de respons van de patiënt op de SOC-therapie. Eerste volledige sequentie sequentiebepaling (WGS) met een laag bereik wordt uitgevoerd. Op basis van de waargenomen frequentie van SCNA's zal een GBM-specifieke PCR amplicon-gebaseerde gerichte re-sequentiebepalingsassay voor mutatie en SCNA's worden ontwikkeld. Later zal een breed bioinformatica-platform worden ontwikkeld om NGS-analyse mogelijk te maken die zowel mutatie- als SCNA-gegevens ondersteunt. Onderzoeksoutput en benutting: i) Ontwikkel en valideer een mutatie en SCNA anaylsis-pijplijn die breed kan worden gebruikt, uitgaande van gerichte re-sequentiebepalingsassays in heterogene tumoren zoals GBM. ii) Ontwikkeling van prototype GBM klinische behandelingsbeslissingstesten die mutatie / SCNA's dekken.