Identificeren van functionele genomische varianten voor cryptorchidie en scrotal hernia bij varkens

Aangeboren afwijkingen blijven een probleem bij varkens, waarbij cryptorchidie en scrotal hernia de belangrijkste zijn. Dit project zal een bijdrage leveren aan de genetische selectie tegen deze 2 aandoeningen in 2 lijnen van eindberen. De start hypothese voor beide aandoeningen is een polygene vererving met mogelijks slechts gedeeltelijk penetrantie. Omdat de steekproefgrootte niet toelaat om voldoende power te halen met een Genome Wide Association studie wordt gekozen om een dierexperiment uit te voeren waarbij aangetaste dieren worden gefokt via terugkruising. Weefselstalen van aangetaste en niet-aangetaste dieren voor beide defecten zullen gebruikt worden in genomische en transcriptoomanalyses. De integratie van genomics (whole genome sequencing) en transcriptomics (RNA sequencing) zal toelaten om functionele genetische varianten te identificeren voor cryptorchidie en scrotal hernia.

Trefwoorden:genetic defect, scrotal hernia, cryptorchidism, pig, transcriptomics, genomics

Disciplines:Microbiologie