Moleculair ontwerp van 'Bevrozen Aptameren': Aptameren met verbeterde eigenschappen door covalente en niet-covalente stabilisatie met gefunctionaliseerde nucleotiden:een gecombineerde NMR, modellering en electrochemie aanpak.

De on-site en zeer selectieve detectie van cocaïne en andere belangrijke doelanalyten zoals antibioticaresiduen in afvalwater blijft een uitdagend onderzoeksgebied. In dit project wensen we analytische detectiesystemen die korte DNA-sequenties gebruiken voor selectieve herkenning van interessante moleculen - aptameren genaamd - gevolgd door het genereren van elektrische signalen na binding beter te begrijpen en uiteindelijk te verbeteren. Om dit te bereiken zullen we eerst de fundamentele aspecten bestuderen aangaande de invloed van structuur en flexibiliteit van aptameren op bindend en elektrochemisch signaal. Dit wordt verder in kaart gebracht met behulp van computermodellering, NMR-spectroscopie en ITC-metingen. Na het verkrijgen van structurele kennis, streven we ernaar om de aptameren met hoge affiniteit chemisch te stabiliseren door introductie van chemisch gemodificeerde bouwstenen in de aptameer nucleïnezuursequentie. De aldus in de aptamer geïntroduceerde additionele functionele groepen zouden het mogelijk moeten maken om de stabiliteit van de gevouwen ligand-bindingstoestand van het aptameer te verbeteren. Op deze manier hopen we bij te dragen aan de ontwikkeling van meer robuuste apasensoren. Dit moet uiteindelijk en op de lange termijn leiden tot verbeterde, robuuste, eenvoudige en mobiele apparaten die ter plaatse kunnen worden ingezet in verschillende toepassingsgebieden.

Trefwoorden:APTAMEREN

Disciplines:Elektrochemie

Project type:Samenwerkingsproject