Single cel omica in hoge doorvoer en spatiale resolutie

Een menselijk lichaam omvat 10 tot 100 biljoen cellen (= 10 tot 100 x 1000.000.000.000 cellen). Aangezien de meeste van onze orgaanfuncties worden uitgevoerd door de gecoördineerde werking van die individuele cellen in een ruimtelijk georganiseerde context, is het belangrijk om individuele cellen te onderzoeken in hun eigen ruimtelijke context. Dit is niet alleen belangrijk om normale orgaanontwikkeling en -functie te begrijpen, maar ook om te onderzoeken hoe (subpopulaties van) cellen verstoord raken bij ziekten als kanker of neurologische stoornissen. Dit project zal een vierde generatie sequencing-apparaat oprichten die de ruimtelijke coördinaten van RNA- en DNAsequenties in weefselsecties behoudt met subcellulaire resolutie, waardoor sequenties van DNA of RNA-moleculen in individuele cellen kunnen gelokaliseerd worden in hun oorspronkelijke histologische weefselcontext. Naast in situ sequencing technologie, zal hetzelfde apparaat ook het detecteren en visualiseren van transcripten van 100’en tot 1000’en genen binnen individuele cellen zeer nauwkeurig en met ruimtelijke inter- en intracellulaire informatie mogelijk maken. Accessoires zullen het tevens mogelijk maken om DNA en RNA van individuele cellen in hoge doorvoer te ondervragen en verdere methode ontwikkeling te stimuleren. Sequentie analyses van individuele cellen revolutioneren ons begrip van de omvang, de natuur en de biologie van cellulaire diversiteit die optreedt in een gezond organisme en bij ziekte.