Genomische barcoding als een hulpmiddel om illegaal gekapte Afrikaanse bomen te traceren en te identificeren

De toename van de vraag naar hout dat voorkomt sinds het midden van de 20e eeuw, evenals de verbetering van oogst- en verwerkingstechnologieën en het transportnetwerk, resulteerde in het verlies van enorme bosgebieden, met een negatieve impact op het bosecosysteem en de wereldwijde biodiversiteit in de tropen. Tot 90% van het jaarlijkse houtvolume wordt verkregen door illegale houtkapactiviteiten in Centraal-Afrika. Traditionele taxonomische methoden, waaronder de visuele en microscopische analyse van houtmonsters en voortplantingsorganen, niet vaak toestaan om nauw verwante soorten en individuen te onderscheiden op subspecies niveau. Voor deze reden, planten DNA-barcodes, waaronder genetische markers in het plastidegenoom en nucleair ribosomale genoom werden ontwikkeld, resulterend in de toename van de identificatie van veel plantensoorten. Deze markers zijn echter niet geschikt voor de identificatie van een breed bereik van plantensoorten. Daarom bestaat de uitdaging voor het plantenonderzoek uit de ontwikkeling van nieuwe DNA barcoding en sequencing technologieën voor de universele identificatie van planten soorten. Dit is essentieel om de impact van illegale houtkapactiviteiten op de plant te verminderen biodiversiteit in de tropen. Het doel van het project bestaat uit de kosteneffectieve ontwikkeling high-throughput sequencing-technologieën voor de snelle en betrouwbare identificatie van illegaal gekapte Centraal-Afrikaanse boomsoorten in het kader van CITES en EU-hout Regulatie. Ten eerste zal het genoom skimming door shotgun sequencing-techniek zijn uitgevoerd om een genetische referentiedatabank te produceren met inbegrip van het plastidegenoom van commerciële houtsoorten van belang voor de internationale handel. Vervolgens soortspecifiek DNA barcodes zullen worden geproduceerd en moleculaire protocollen voor houtanalyse zullen worden geoptimaliseerd. Ten slotte zullen we een populatiegenetwerkbenadering uitvoeren om polymorfismen in een aantal van de te identificeren de belangrijkste commerciële houtsoorten, om de oorsprong vast te stellen en herkomst van houtmonsters onder de internationale handel. Deze bevindingen zullen worden gebruikt als een instrument voor de handhaving van de bosbouwverordening en de opname van deze soorten in de CITES-bijlagen.