Onderzoek naar de rol van nieuwe O-methyltransferases in het phenylpropanoidmetabolisme

Fenylpropanoiden vormen een specifieke klasse van secundaire metabolieten in planten die een rol spelen in tal van processen zoals ziekteresistentie, ontwikkeling en adaptatie. Vele fenylpropanoiden hebben ook een geneeskrachtige werking. Fundamentele kennis over hun biosynthese kan helpen stressresistentie en voedingswaarde van planten op te drijven. Ondanks jarenlang onderzoek blijft onze kennis over de biosynthese van fenylpropanoiden en aanverwante moleculen onvolledig. In dit project wensen we de substraten en producten van een reeks tot hiertoe onbekende O-methyltransferasen (OMTs), die waarschijnlijk betrokken zijn in fenylpropanoid biosynthese, op te helderen in Arabidopsis. Als voorbereiding werd een lijst van kandidaat OMTs opgesteld die gebaseerd is op literatuur, en op  fylogenie-, expressie- en co-expressiegegevens. Mutanten in deze genen zullen worden geanalyseerd door middel van vloeistofchromatografie (LCMS) om differentieel accumulerende fenylpropanoiden op te sporen, gevolgd door zuivering van een aantal van deze componenten voor verdere structuuropheldering door NMR. Vervolgens zal de enzymatische functie van de OMTs verder onderzocht worden door enzymatische assays. Op deze manier hopen we nieuwe enzymen te ontdekken, samen met hun substraten en producten. Vervolgens zal een meer gedetailleerde studie worden uitgevoerd op een van deze enzymen, afhankelijk van zijn functie en het belang ervan voor de maatschappij.