Pathologische bloedvat hermodulering in leverziekte: een single cel transcriptoom studie om nieuwe targets te identificeren

Hepatocellulair carcinoom (HCC) wordt gekenmerkt door een drastische vasculaire hermodellering inclusief arteriële hypervascularisatie (AH), die de bloedtoevoer naar de groeiende tumor aanzienlijk verhoogt, maar ook sinusoïdale microvasculaire capillarisatie (MVC), die zuurstofoverdracht belemmert, hypoxie creëert en daardoor HCC-groei bevordert. De moleculaire mechanismen die de veranderingen in de respectieve bijdragende cellen (arterieel en sinusoïdaal endothele cellen, Kupffercellen, gladspierweefselcellen, stellaatcellen, etc.) aandrijven, zijn echter weinig begrepen, wat waarschijnlijk verklaart waarom traditionele anti-angiogene therapieën onvoldoende werkzaam zijn en geconfronteerd worden met resistentie. Ik zal proberen deze leemte in kennis op te vullen door het toepassen van single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) van vasculaire cellen in HCC versus gezond leverweefsel om regulatoren van de AH/MVC-responsen in HCC te identificeren. De scRNA-seq profileringsaanpak kan op unieke wijze de volledige complexiteit van AH/MVC vatten, die vereist is om per celtype de mechanismen die de pathologische veranderingen sturen, te ontrafelen. Zowel de scRNA-seq als de bioinformatica-analyse van single-cell profileringsgegevens zijn operationeel in het gastlaboratorium. De resultaten zullen een rijke bron van nieuwe gegevens opleveren, waaronder mogelijke targets, waarvoor ik zal onderzoeken of de behandeling van deze targets de AH/MVC-gerelateerde processen kan remmen. Deze targets kunnen dan worden overwogen voor de toekomstige anti-angiogenese ontwikkeling van HCC.