< Terug naar vorige pagina

Project

Identificatie van nieuwe genetische en epigenetische mechanismen bij het ontstaan van orofaciale schisis via exoom sequencing, opsporen van DNA elementen en p63 transcriptiefactor bindingsplaatsen

Orofaciale schisis van lip, kaak en/of gehemelte (OFS) is een van de meest voorkomende aangeboren afwijkingen bij de mens. Wereldwijd treft het 1 op de 700 levendgeborenen. Niet syndromale OFS (nsOFS) is een complexe aandoening die ontstaat door een combinatie van genetische risicofactoren of gevoeligheden en blootstelling aan risicofactoren uit het milieu in de baarmoeder. Het aantal individuen waarbij OFS veroorzaakt wordt door mutaties in de coderende regio van het genoom, wordt erg gering geacht. Deze worden echter wel verondersteld oorzakelijk te zijn in families met meerdere aangedane leden. In dit project werd exome sequencing uitgevoerd bij 2-3 aangedane individuen uit aangedane families en de gevonden varianten worden genetisch gevalideerd in alle aangedane en niet aangedane familieleden die wensen deel te nemen aan het onderzoek. Bij de families waarbij geen mutaties zijn gevonden in de coderende varianten, zullen de niet-coderende delen van het genoom worden onderzocht op de aanwezigheid van bijzondere variaties (zoals SNPs) in de regulerende DNA-elementen, zoals in specifieke motieven in de DNA-bindingsplaatsen (bp) van transcriptiefactoren. Hier wordt specifiek gekeken naar bindingsplaatsen voor de transcriptionele regulator TP63, vooral in de nabijheid van bekende genen voor nsOFS die gekoppeld zijn met SNPs in een GWAS gebied, zoals de IRF6 enhancer, die stroomopwaarts ligt van het IRF6 gen. De sequentievariaties in de TP63 bp van deze enhancer zijn geassocieerd met een verhoogd risico op nsOFS.   Er wordt ook naar het 8q24 gebied gekeken waarvan is aangetoond dat het significant geassocieerd is met nsOFS in verschillende GWAS studies.

Datum:1 mrt 2016 →  26 jun 2018
Trefwoorden:Humane gezondheid, medische technologie, biowetenschappen
Disciplines:Laboratoriumgeneeskunde, Palliatieve zorg en zorg rond het levenseinde, Regeneratieve geneeskunde, Andere basiswetenschappen, Andere gezondheidswetenschappen, Verpleegkunde, Andere paramedische wetenschappen, Andere translationele wetenschappen, Andere medische en gezondheidswetenschappen, Genetica, Systeembiologie, Moleculaire en celbiologie