Integratieve Structuurbiologische Benadering van Intermediaire Filamenten

Ons onderzoek richt zich op de driedimensionale structuur van intermediaire filamenten (IF). IFs vormen samen met microtubules en actinemicrofilamenten een filamenteus systeem van het eukaryote cytoskelet. Er zijn zes verschillende soorten van IFs die in verschillende cellen functioneren. Hun belangrijkste rol is het versterken van de cel om externe stress en spanningen te weerstaan. Het aantal ziekten geassocieerd met de IFs blijft groeien. Hun mechanismen zijn geassocieerd met mutaties in IF-genen. De structurele organisatie van de IF's is een groot onopgelost probleem dat essentieel is voor het ontwikkelen van behandelstrategieën. We moeten de bottom-up benadering toepassen om na te gaan hoe het filamenteuze systeem wordt gevormd uit IF dimeren die elementaire bouwstenen zijn van het netwerksysteem. Recente kristallografische studies van de fragmenten van het dimeer hebben een bijna compleet beeld opgeleverd van IF dimeer, maar deze gegevens zijn niet voldoende voor valide computationele modellering van het assemblagemechanisme. Experimentele gegevens voor hogere niveaus van IF-architectuur kunnen de noodzakelijke input bieden voor computationele modellering. Om deze gegevens te verkrijgen, omvat ons project recombinante eiwitisolatie, kristallisatie, röntgenkristallografische studies en aanvullende biofysische en biochemische experimenten.