Structuur-functie analyse van prokaryotische koolhydraatbindende antibacteriële en antivirale proteïnes.

Bacteriocines zijn krachtige ribosomaal gesynthetiseerde toxines die geproduceerd worden door bacteriën en selectief fylogenetisch verwante concurrenten afdoden. Op deze manier zijn ze complementair aan het antagonistische spectrum van antibiotica die typisch niet-verwante bacteriën als doelwit hebben. Het primaire doel van dit project is om het werkingsmechanisme van een lectine-achtig bacteriocine, LlpA genaamd, op te helderen. Om inzicht te verwerven in de toxische effecten van LlpA zal een gecombineerde strategie gevolgd worden: (i) identificatie van LlpA-resistentiedeterminanten; (ii) bepaling van transcriptieprofielen van gevoelige cellen blootgesteld aan lage concentraties van LlpA; en (iii) studie van de fysische interactie van LlpA met doelwitcellen. Daarnaast focust dit project op een nieuw subtype lectine-achtig bacteriocine met een verschillende domeinorganisatie. De doelwitstamspecificiteit, suikerbindende capaciteit en de kristalstructuur van dit nieuwe proteïne zullen bepaald worden. Finaal zal er gefocust worden op een bacterieel lectine-achtig proteïne dat geen antibacteriële, maar wel antivirale activiteit vertoont. De 3D-structuur en suikerspecificiteit vormen onderwerp van onderzoek, samen met de affiniteit voor virale determinanten.

Trefwoorden:Antagonism, Crystal structure, Lectin, Bacteriocin, LlpA

Disciplines:Microbiologie, Systeembiologie, Laboratoriumgeneeskunde