Epigenetische factoren die tumor heterogeniteit bepalen

Kankercellen tonen heterogeniteit op verschillende niveaus, waardoor de resistentie van de tumor wordt verhoogd. Geen studie heeft echter systematisch de oorzaken van tumor heterogeniteit onderzocht, onder meer door historisch gebrek aan passende methoden. Gezien de betrokkenheid van het epigenoom bij transcriptie-regulering en de controle die sommige epigenetische enzymen op transcriptie-heterogeniteit kunnen uitoefenen, stellen wij dat tumor heterogeniteit onder epigenetische controle is en een therapeutisch doelwit kan vormen. Om dit te testen, ontwikkelen we state-of-the-art genetische knock-out screens gecombineerd met single-cell RNA sequencing, teneinde de epigenetische enzymen die transcriptie-heterogeniteit regelen te identificeren. We zullen ook methodes ontwikkelen om heterogeniteit van DNA-methylatie in patiëntentumoren te kunnen meten. Tenslotte willen we testen of inactivatie van de enzymen en pathways die we identificeren, effect hebben op het ontwikkelen van resistentie tegen medicijnen of van metastatische eigenschappen.

Trefwoorden:Epigenic

Disciplines:Genetica, Systeembiologie, Moleculaire en celbiologie