Fylodynamische analyse van pathogenen, uitvoerbaar in reële tijd

Voor de meest voorkomende besmettelijke ziektes bestaan intussen grote hoeveelheden gen- en genoomsequenties, zodat veel van de huidige (fylogenetische) analyses niet meer haalbaar zijn vanuit computationeel oogpunt. Dit project beoogt de ontwikkeling van statistische en computationele methoden om op een efficiënte manier epidemiologische en evolutionaire informatie te bepalen tijdens een epidemie. Het reconstrueren van de verspreiding van pathogenen uit genetische data vormt een statistisch scenario waarbij data punten sequentieel in de tijd geobserveerd worden en welke tijdig moeten geanalyseerd worden. De doelstelling van dit project is dus om bestaande fylodynamische analyses uit te breiden met nieuwe data om zodoende de tijdsvereisten van dergelijke analyses drastisch te verkorten, met behulp van een combinatie van statistische en computationele methoden.

Trefwoorden:pathogenen

Disciplines:Microbiologie, Systeembiologie, Laboratoriumgeneeskunde