Toepasbaarheid en limitaties van eiwit aggregatie als ontwerpmethode voor nieuwe antimicrobiëele stoffen

We hebben recent een nieuwe methode voor eiwit functionele knockdown ontwikkeld dat specifieke eiwitmisvouwing induceert aan de hand van korte amyloidogene peptides. Deze methode werd reeds gevalideerd in tumor cellen (Gallardo et al, 2016, Science) & planten (Betti et al, 2016, Plant Physiol). De aanwendbaarheid in vivo van deze methode voor de ontwikkeling van nieuwe antibiotica werd eveneens aangetoond voor gram-positieve (Bednarska et al, Mol Microbiol, 2015) en gram-negatieve (Khodaparast et al, 2016, submitted to Cell) bacterien. Ons laboratorium werkt actief aan het opzetten van een biotech startup voor de productontwikkeling van deze nieuwe antibiotische peptides. Echter, een aantal belangrijke mechanistische aspecten van de werking van deze peptides dient in meer detail te worden onderzocht om ons ervan te verzekeren dat de translatie tot product succesvol kan gebeuren. Met dit project wensen het Switch Laboratory (Rousseau) & het laboratorium voor Clinische Bacteriologie & Mycologie (Van Eldere) de krachten verenigen om een systematische genetische screen uit te voeren screen in het clinisch relevante model organism E coli naar genen die peptide uptake, aggregatie en inclusievorming affecteren evenals peptide toxiciteit en bacrziele resistentie. We zullen ook screenen voor peptides die een activiteitsspectrum hebben tegen resistente strains (Klebsiella, Pseudomonas, Acinetobacter) 

Trefwoorden:protein kinase D

Disciplines:Laboratoriumgeneeskunde, Palliatieve zorg en zorg rond het levenseinde, Regeneratieve geneeskunde, Andere basiswetenschappen, Andere gezondheidswetenschappen, Verpleegkunde, Andere paramedische wetenschappen, Andere translationele wetenschappen, Andere medische en gezondheidswetenschappen