Het bacteriële proteïne kwaliteitscontrole systeem als potentieel target voor nieuwe antibiotica.

De proteïne synthese in bacteriën wordt ondersteund door verschillende proteasen en chaperones. Ze helpen foutief gevouwen peptideketens op eencorrecte manier te vouwen of breken verkeerd gevouwen proteïnen af. De proteasen en chaperones hebben uiteenlopende functies, gaande van regulerende functies tot bescherming bij stressomstandigheden. Enkele recente bevindingen suggereren dat ze mogelijke doelwitten vormen voor nieuwe antibiotica. Tot op heden zijn er nog geen antibiotica commercieel beschikbaar die inwerken op de proteïneafbraak en -kwaliteitscontrole. De antibiotica die metabool inwerken, interfereren met de DNA-replicatie, de RNAsynthese of proteïnesynthese. In dit project wordt nagegaan of het bacteriële systeem dat instaat voor de kwaliteitscontrole op proteïnen een mogelijk doelwit is voor nieuwe antibiotica, en of dit doelwit eventueel een strategie kan bieden voor de aanpak van biofilms. Bacteriën die groeien in een biofilm zijn erg moeilijk te bestrijcen met de bestaande antibiotica vanwege een lagere metabole activiteit. Vaak bestaat de enige effectieve behandeling uit het verwijderen van het materiaal waarop de biofilm gevormd werd. Dit project zal via RT-PCR nagaan hoe de expressie ven de verschillende componenten van het bacteriële proteïne kwaliteitscontrolesysteem verandert gedurende de groei en de biofilmvorming. Verder zal geprobeerd worden via mutaties na te gaan of bepaalde componenten vanhet systeem noodzakelijk zijn voor de overleving van de bacteriën. Tot slot zal er getracht worden een doelwit te identificeren en een assay opte stellen om een productbibliotheek te screenen.

Trefwoorden:Biofilm, Staphylococcus aureus, RT-PCR, Chaperones, Proteases, Antibacterial strategies

Disciplines:Biochemie en metabolisme, Medische biochemie en metabolisme, Immunologie, Microbiologie, Systeembiologie, Laboratoriumgeneeskunde, Andere biologische wetenschappen

Project type:PhD project