< Terug naar vorige pagina
Project
Microbiële metagemeenschapsecologie: lineagesorting, dispersie en evolutie in de waterkolom biofilmecotone van ondiepe meren.
Bacteriële gemeenschappen zijn essentieel voor het functioneren van natuurlijke ecosystemen (bv. nutriëntencycli), spelen een belangrijke rol in tal van industriële processen (bv. biologische afvalwaterzuivering, voedselfermentatie), en kunnen grote (economische) schade veroorzaken (bv.pathogenen, biofouling, voedselbederf). Desondanks zijn de ecologische processen die de soortensamenstelling van natuurlijke bacteriële gemeenschappen bepalen onvoldoende gekend. Geven specifieke lokale omgevingscondities steeds aanleiding tot dezelfde voorspelbare gemeenschapssamenstelling door sterke lineage sorting (d.i. lokale selectie door (a)biotischefactoren)? En wat is het relatief belang van processen op metagemeenschapsniveau, zoals dispersie, immigratiehistoriek en evolutie?
Indit onderzoek zullen we het relatief belang van lineage sorting, massa-effecten, prioriteitseffecten en evolutie voor de samenstelling van bacteriële gemeenschappen kwantificeren en de impact van differentiële gemeenschapsopbouw op de functionaliteit onderzoeken. Natuurlijke planktonische en biofilmgemeenschappen uit verschillende vijvertypes worden in het labo aan elkaar blootgesteld onder specifieke experimentele opstellingen, zoals een gradiënt van artificiële dispersie (massa-effecten) of verschillende immigratiehistorieken (prioriteitseffecten). De bacteriële gemeenschapssamenstelling wordt geanalyseerd door t-RFLP en 454-pyrosequencing, gevolgd door multivariate statistische analyse. Door natuurlijke gemeenschappen uit ondiepe meren te gebruiken wordt inzicht verworven in deprocessen binnen soortenrijke systemen, hetgeen de relevantie van dit onderzoek voor toegepaste microbiologie maximaliseert.
Indit onderzoek zullen we het relatief belang van lineage sorting, massa-effecten, prioriteitseffecten en evolutie voor de samenstelling van bacteriële gemeenschappen kwantificeren en de impact van differentiële gemeenschapsopbouw op de functionaliteit onderzoeken. Natuurlijke planktonische en biofilmgemeenschappen uit verschillende vijvertypes worden in het labo aan elkaar blootgesteld onder specifieke experimentele opstellingen, zoals een gradiënt van artificiële dispersie (massa-effecten) of verschillende immigratiehistorieken (prioriteitseffecten). De bacteriële gemeenschapssamenstelling wordt geanalyseerd door t-RFLP en 454-pyrosequencing, gevolgd door multivariate statistische analyse. Door natuurlijke gemeenschappen uit ondiepe meren te gebruiken wordt inzicht verworven in deprocessen binnen soortenrijke systemen, hetgeen de relevantie van dit onderzoek voor toegepaste microbiologie maximaliseert.
Datum:1 okt 2011 → 8 jan 2016
Trefwoorden:Metacommunity ecology, Aquatic ecosystems, Eco-evolutionary dynamics, Priority effect, Mass effect, Dispersal limitation, Prokaryotes, Lineage sorting
Disciplines:Geologie, Aquatische wetenschappen, uitdagingen en vervuiling, Dierkundige biologie, Visserij
Project type:PhD project