Ontrafelen van de alveolaire macrofaag niche om longziekten beter te kunnen begrijpen

De alveolaire macrofaag (AM) is de meest voorkomende immuuncel in de gezonde long. Ze werken als stofzuigers van de longblaasjes, maar hebben oo een unieke metabolische en herstelfunctie die essentieel is voor homeostase in het alveolaire compartiment. AMs zijn een essentieel onderdeel van de alveolaire niche die bestaat uit alveolaire epitheelcellen, capillaire endotheelcellen en alveolaire interstitiële fibroblasten en vormen de voedingsbodem voor AMs om in te gedijen. Toch ontbreekt een gedetailleerde analyse van de ontwikkeling van AMs, gezien adequate middelen voor specifieke AM depletie ontoereikend zijn. Gebruik makend van een nieuw transgeen muismodel die specifieke AM depletie toelaat, zullen we de de veranderingen bestuderen van voorlopercellen die ontwikkelen tot AMs met flowcytometrie en CITE-seq. We zullen deze veranderingen correleren met de niche signalen die deze voorlopercellen ontvangen om licht te werpen op welke ligand-receptor interacties betrokken zijn in hun ontwikkeling tot AM, aangevuld met een gedetailleerde epigenetische analyse. we zullen vervolgens deze bevindingen valideren met een CRISPR/Cas9 model waar we selectief deze genen uitschakelen in AM-voorlopers en hun ontwikkeling volgen in muizen zonder AMs. Tenslotte zullen we bestuderen of chronische blootstelling aan sigarettenrook of boerderijstof de alveolaire niche communicatie, AM heterogeniteit en het AM epigenetische profiel verandert en of dit ontstekingsprocessen in de long beïnvloedt.